Nu har jag inte en aning om riktigt vilka system du använder eller hur de är confade men generellt så när systemet inte har unmountat filsystemet så markeras det inte att det har unmounats "clean".
Detta innebär att vid nästa start så forceras en fsck (förutsatt att du har skrivit in i fstab att just den partitionen ska kolls över huvud taget...brukar sluta med "0 1", "1 2" eller liknande. 0 0 så kollar den inte).

*Alltså, om filsystemet inte unmountas korrekt så bör systemet automagiskt köra en fsck vid reboot.*